โรงเรียนบ้านขุนห้วยไคร้ได้รับอนุมัติจัดตั้งเป็นโรงเรียน สาขาของโรงเรียนบ้านตับเต่า เมื่อวันที่ 23 เมษายน พ.ศ.2528 โดยสร้างอาคารเรียนชั่วคราว 1 หลังให้งบประมาณทั้งสิ้น 3,000 บาทเปิดให้สอนชั้นประถมศึกษาปีที่ 1 มี จำนวนนักเรียนทั้งสิ้น 32 คน นายบุญค้ำ ดอนเลย เป็นครูประจำชั้น ในปี พ.ศ. 2529 ได้รับงบประมาณสร้างบ้านพักครู แบบ สปช. 302/2528 จำนวน 1 หลัง ในเดือนตุลาคม พ.ศ. 2529 กรมทางหลวงชุดที่ 4 ซึ่งเป็นหน่วยสำรวจ ออกแบบสร้างทาง ได้สร้างส้วมให้โรงเรียน 2 ที่นั่ง (ปัจจุบันชำรุดเสียหายใช้การไม่ได้ และได้รื้อถอนไปแล้ว) เดือนธันวาคม พ.ศ.2530 นักศึกษาชมรมค่ายอาสาพัฒนาชนบทมหาวิทยาลัย เชียงใหม่ได้สร้างอาคารเรียนชั่วคราวให้ 1 หลังใช้งบประมาณ 10,000 บาท (อาคาร 1) การเรียนการสอนใช้วิธีสอนแบบ RIT วันที่ 23 พฤษภาคม พ.ศ. 2532 ได้รับอนุมัติจาก สปจ. เชียงราย ได้แจกเป็นโรงเรียนหลัง โดยใช้ชื่อว่า “โรงเรียนบ้านขุนห้วยไคร้” เป็นโรงเรียนลำดับที่ 9 ของกลุ่มตับเต่า (เป็นลำดับที่ 7 ตามหมายเลขที่ของโรงเรียน 1116.040507) จัดกิจกรรมการเรียนการสอนโดยใช้แผนบูรณาการมีนักเรียนทั้งหมด 52 คน นายวรากร อินทะนะรักษาการในตำแหน่งครูใหญ่ ในปี พ.ศ. 2533 ได้จัดการเรียนการสอนแบบ RIT อีกครั้ง โดยมี นายถนอม ต๊ะหล้ารักษาการในตำแหน่งครูใหญ่ วันที่ 11 มีนาคม พ.ศ. 2534 นายอำนาจ คันชิง ครูใหญ่โรงเรียนบ้านขุนสรวย สปอ. แม่สรวย ได้ย้ายมาดำรงตำแหน่งครูใหญ่คนแรกของโรงเรียนนี้ จัดการเรียนการสอนโดยใช้แบบ RIT ผสมแผนบูรณาการ ในปลายปีนี้เองมีนักเรียนจบชั้นป. 6 รุ่นแรกของโรงเรียนจำนวน 7 คน วันที่ 14 มีนาคม พ.ศ. 2534 คณะนักศึกษามหาวิทยาลัยหอการค้าไทยจำนวน 57 คน ได้มาสร้างอาคาร เรียนชั่วคราวกึ่งถาวร ขนาด 5 × 12 เมตร เสาธงชาติสูง 9 เมตร ใช้งบประมาณทั้งสิ้น 120,000 บาท วันที่ 5 กันยายน พ.ศ.2534 นายอำนาจ คันชิงได้ย้ายไป ดำรงตำแหน่ง ครูใหญ่ โรงเรียนบ้านรักถิ่นไทย และนายจำเริญ สักลอ ได้มาดำรงตำแหน่งแทน วันที่ 20 พฤษภาคม 2536 นายเลื่อน ใจแปง ได้ย้ายมาดำรงตำแหน่งแทน นายจำเริญ สักลอ ซึ่งย้ายไปรับตำแหน่งที่สูงขึ้น วันเสาร์ที่ 13- วันอังคารที่ 30 พฤศจิกายน พ.ศ. 2536 คณะนักศึกษามหาวิทยาลัยรามคำแหงกลุ่ม “ส่องไท” ได้สร้างอาคารอเนกประสงค์ให้โรงเรียน 1 หลัง (อาคาร 3) ขนาด 6 × 18 เมตร ใช้งบประมาณ 80,000 บาท วันที่ 24 – 29 มิถุนายน พ.ศ. 2539 คณะครูและชาวบ้านร่วมกันบริจาคทรัพย์และแรงงานสร้างอาคารห้องครัวห้องตัดผม และที่ดื่มน้ำใช้งบประมาณทั้งสิ้น 21,000 บาท วันที่ 8- 21 มีนาคม พ.ศ. 2540 นักศึกษาคณะเภสัชกรรมมหาวิทยาลัยมหิดล ได้สร้างส้วม 3 ที่นั่ง อาคารเรียน 5 × 18 เมตร ให้ 1 หลัง ใช้งบประมาณทั้งสิ้น 145,000 บาท วันที่5 พฤษภาคม 2541 คณะครู ราษฎรบ้านขุนห้วยไคร้และหน่วยงานในพื้นที่ ( อุทยานแห่งชาติภูซาง) ได้บริจาคทรัพย์สร้างอาคารเรียนก่อนเรียนก่อนประถมศึกษา จำนวน 1 หลัง (อาคาร 6) ขนาด 4× 10 เมตร ใช้งบประมาณทั้งสิ้น 78,300 บาท พ.ศ.2542 คณะครู ราษฎรบ้านขุนห้วยไคร้และคณะครูกลุ่มโรงเรียนตับเต่า ได้จัดผ้าป่าสามัคคีขึ้น เพื่อนำเงินมาพัฒนาโรงเรียนทางโรงเรียนจึงปรึกษากับชุมชนและนำเงินมาสร้างอาคารอำนวยการ 1 หลัง ขนาด กว้าง4 × ยาว 13 เมตร ใช้งบประมาณทั้งสิ้น 119,990 บาทถ้วน วันที่ 10 ตุลาคม 2544 นายเลื่อน ใจแปง ผู้อำนวยการโรงเรียนได้รับคำสั่งย้ายไปดำรงตำแหน่ง ผู้อำนวยการโรงเรียนบ้านป่าแดง สปอ. ขุนตาล วันที่ 15 ตุลาคม 2544 นายบุญธรรม ยังไว ผู้อำนวยการโรงเรียนบ้านปางปอ สปอ. เวียงแก่น ย้ายมาดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนบ้านขุนห้วยไคร้ วันที่ 15 ธันวาคม 2544 คณะนักศึกษาวิทยาลัยเทคนิคพะเยา จำนวน40 คน มาร่วมพัฒนาโรงเรียน และจัดสร้างสนามเด็กเล่น แจกสิ่งของหนังสือห้องสมุด วันที่ 1 กรกฎาคม 2546 นางพรกมล ทะระมา ย้ายไปดำรงตำแหน่งที่โรงเรียนบ้านม่อนป่ายาง สปอ. เทิง และวันที่ 4 กรกฎาคม 2546 นางภัทฐิตา ดอนสินเพิ่ม ข้าราชการครูจากโรงเรียนปอวิทยา สปอ. เวียงแก่น ย้ายมาดำรงตำแหน่งในโรงเรียนบ้านขุนห้วยไคร้ วันที่ 1 ตุลาคม 2547 นางสาวภัสริน อินสาร มาบรรจุใหม่ ในตำแหน่งอาจารย์ 1 ระดับ 3 วันที่ 29 พฤศจิกายน 2547 นางภัทฐิตา ดอนสินเพิ่ม ย้ายไปดำรงตำแหน่งใหม่ที่โรงเรียนบ้านสันทรายมูล สพท.ชร.เขต 4 อ.เท